اولین برنامه های تحقیقاتی و توسعه ای میوه کاری در ایران در اداره فلاحت با ریاست دانشمند برجسته و پیشکسوت میوه کاری ایران، مرحوم مهندس عباسعلی منیعی در سال 1330 آغاز شد و در مرحله اول تا سال 1339 در ذیل این اداره ادامه یافت. در سال 1339 هم‌زمان با تأسیس مؤسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، فعالیت‌های تحقیقاتی باغبانی در مجموعه‌ای تحت عنوان اداره کل بررس ی‌های باغبانی ادامه یافت و مهندس عباسعلی منیعی ریاست این اداره را تا سال 1345 همچنان بر عهده داشت. هدف از تأسیس این اداره در ابتدا بررسی و ازدیاد میوه، سبزی و گل و گیاهان زینتی بود و طی این دو دوره بسیاری از ارقام مختلف درختان میوه اعم از ارقام بومی و یا وارداتی گردآوری و در کلکسیون هایی در محل فعلی ستاد موسسه اصلاح و تهیه نهال و بذر و یا شهرک نهال و بذر کشت و مورد ارزیابی قرار گرفتند. ارقام برتر گزینش شده کلکسیون های درختان میوه اداره بررسی های باغبانی طی برنامه های تکثیری انبوه این اداره به تدریج در سرتاسر کشور گسترش یافت و اولین نهال های اصلاح شده و برتر درختان میوه طی تلاش های انجام گرفته در این اداره به دست تولید کنندگان میوه رسید. ریاست بخش تحقیقات باغبانی پس از سال 1345 و تا سال 1350 بر عهده مرحوم مشیت الله وجدانی بود.

مرحوم مهندس عباسعلی منیعی (تولد 1298 هجری شمسی در تبریز)، دانشمند برجسته و پیشکسوت میوه کاری ایران و رئیس اداره بررسی های باغبانی در بین سال های 1330 تا 1345 در اداره فلاحت و موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر

نمونه ای از ارزیابی های کلکسیون های مختلف گیلاس و آلو و گوجه طی دهه 50 هجری شمسی در بخش تحقیقات باغبانی توسط علی اصغر دخت فرج، کارشناس میوه های معتدله و سردسیری (عکس اهدائی از علی اصغر دخت فرج)

در سال 1350 اداره بررسی های باغبانی، به بخش تحقیقات باغبانی تغییر نام داده و فعالیت‌های آن در ذیل موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر ادامه یافت. پس از آن در سال‌های 1357 ،1371 ،1372 ،1375 و 1381 به ترتیب بخش تحقیقات سبزی و صیفی، مؤسسه تحقیقات پسته، مؤسسه تحقیقات خرما و میوه‌های گرمسیری، مؤسسه تحقیقات مرکبات و مرکز ملی گل و گیاهان زینتی از این بخش جدا و فعالیت خود را به صورت مستقل آغاز نمودند. از آن پس فعالیت‌های تحقیقاتی بخش باغبانی در مؤسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر معطوف به سایر محصولات باغبانی شامل درختان میوه دانه‌دار، هسته‌دار، خشك و آجیلی، ریزمیوه‌ها ، درختان میوه نیمه گرمسیری و زعفران  گردید. در سال 1374 بر اساس تنوع ویژگی‌های محصولات مورد بررسی، بخش تحقیقات باغبانی به واحد های تحقیقاتی مجزا تفکیک  گردید.   مجموعه پروژهای تحقیقاتی ،  در 27 ایستگاه  تحقیقاتی  و مراکز تحقیقاتی آن به 27 عدد افزایش یافت. در فروردین ماه 1395 پس از تشکیل مؤسسه تحقیقات علوم باغبانی، بخش تحقیقات باغبانی به عنوان یکی از هفت پژوهشکده زیر مجموعه مؤسسه مذکور و تحت عنوان پژوهشکده میوه‌های معتدله و سردسیری فعالیت جدید خود را رسماً آغاز نمود. اسامی روسای اداره بررسی های باغبانی، بخش تحقیقات باغبانی و پژوهشکده میوه های معتدله و سردسیری از سال 1330 تاکنون به شرح جدول ذیر آورده شده است:

علاوه بر مرحوم مهندس عباسعلی منیعی، دیگر بزرگان میوه کاری ایران از جمله مهندس محمود درویشیان در راستای اعتلاو پیشرفت هرچه بیش تر علوم میوه کاری ایران اقدامات ارزنده و چشمگیری از خود به جا گذاشتند. در بین روسای بخش تحقیقات باغبانی، لازم است از اقدامات و تلاش های ارزشمند دکتر مصطفی مصطفوی که نقش به سزائی در گسترش باغداری متراکم و به ویژه ترویج پایه های پاکوتاه و نیمه پاکوتاه سیب طی دهه 70 هجری شمسی به عمل آورد، قدردانی نمود.

محققین، کارشناسان و پیشکسوتان بخش تحقیقات باغبانی در سال 1397

پیشکسوتان تصویر شامل دکتر مصطفی مصطفوی، مهندس محمد رضا میرزا­کوچک ­خوشنویس، مهندس جمال عاطفی